Die Verwendung einer Graphdatenbank war eines der Ausgangsziele des virtuellen Archivaufbaus und ein rudimentäres Graphdatenbanksystem gehörte seit der Frühphase zur IT-Infrastruktur. Das in Abschnitt 1.2. besprochene Beispiel diente lediglich zur theoretischen Veranschaulichung des Datenbankparadigmas und stellte im konkreten Fall lediglich eine Kopie der ursprünglichen, relationalen Datenbank dar. Im Verlauf des Projekts, insbesondere bei der Entwicklung der Werkzeuge zur Arbeit mit dem Archiv, wurde schnell klar, dass sich die Datenbankstruktur weiterentwickeln musste, um der komplexen Anordnung der physischen Objekte im Archiv in Newburyport im garfinkelschen Sinne Rechnung zu tragen, den Mehrwert von Graphdatenbanken zu nutzen und diese nicht nur als grafische Repräsentationen von RDBMS zu begreifen und sie schlussendlich zu einem Werkzeug zur Erforschung der Praxeologie der Arbeit mit virtuellen Archiven zu machen.