In Deutschland ist das Umweltschutzrecht im Gegensatz zu anderen Ländern sehr komplex. Da es in Deutschland kein zentrales, alle anzuwendenden Vorschriften zusammenfassendes Umweltschutzgesetz gibt, sind die allgemeinen und speziell für die unbemannte Luftfahrt geltenden Vorschriften in unterschiedlichen Gesetzen und Verordnungen geregelt. Abhängig vom Bundesland können diese Regeln von den Gesetzen des Bundes abweichen. Für die unbemannte Luftfahrt gelten neben dem LuftVg, der LuftVo und der EU-Drohnenverordnung auch die den Umweltschutz betreffenden Gesetze und Verordnungen. Mit der neuen EU-Drohnenverordnung wurde die Anwendung der Umweltgesetze vereinfacht und die Zuständigkeit der Umweltschutzbehörden oberhalb einer Flughöhe von 100 m AGL eingeschränkt. Die schutzwürdigen Interessen müssen bei Überflug von Schutzgebieten aber auch weiterhin berücksichtigt werden. Schutzgebiete haben in Deutschland unterschiedlich hohe Schutzstufen. Davon abhängig werden für die unbemannte Luftfahrt Überflugregeln klassifiziert. Bei der Ermittlung der in einem Fluggebiet relevanten Schutzgebiete kann auf GIS-Portale des Bundes und der Länder zurückgegriffen werden.