Der Schock über den Verlust des geliebten Sohnes hatte ihn schwer getroffen. Auch die robuste Natur eines Johann Lucas Schönlein hatte Schwierigkeiten, dies zu verkraften. Nur seine beiden Töchter waren ihm nun geblieben, die den Vater aufopfernd umsorgten. Aber selbst in seiner Villa im Tiergarten fühlte er sich nicht mehr richtig wohl. Innerlich hatte sich der Professor wahrscheinlich schon von der preußischen Hauptstadt verabschiedet. Dennoch nahm der inzwischen 64-Jährige alle seine universitären Aufgaben unverändert wahr, wie von einem Studenten geschildert: