Neben den vielfältigen Lehrverpflichtungen an der Universität und der Patientenversorgung blieb Schönlein in Zürich aber auch noch genug Muße, um seiner anderen großen Leidenschaft nachzugehen – dem Sammeln von Naturalien aus weit entfernten tropischen Ländern. Wie bereits geschildert hatte er ab 1831 immer wieder Sendungen mit ausgestopften oder konservierten Tieren von seinen Schülern im holländischen Kolonialdienst aus Ostindien erhalten. Der fleißigste Lieferant in dieser Anfangsphase war zweifellos Ludwig Rudolph Besel, der aus Java Säugetiere, Reptilien und Amphibien schickte und sich nach seiner Versetzung auf die Insel Sulawesi auf Vögel und Meerestiere konzentrierte: „4 füßige Thiere gibt es hier wenig […] – ich werde daher meine Hauptandacht auf die See richten, aus der ich schon einiges recht interessantes erhalten habe.“*