Da die HNO-Organe größtenteils im Kopf und Hals versteckt liegen, nutzen die HNO-Ärzte spezielle Spiegeltechniken, Endoskope und das Untersuchungsmikroskop um Licht und Blick in die Organe zu bringen. Zum HNO-Status gehören Otoskopie, Rhinoskopie, Laryngoskopie, Mundhöhlen- und Racheninspektion sowie Palpation des äußeren Halses. Für die Halsorgane wird der Ultraschall eingesetzt. Ein wichtiger Baustein der Diagnostik sind Funktionsuntersuchungen wie Hör- und Gleichgewichtsprüfungen oder Allergietests., Für die spezielle Bildgebung wie Computertomografie und Magnetresonanztomografie wird an Radiologen überwiesen. Gewebeproben, Abstrichmaterial oder Blutproben werden an Pathologen und Laborärzte versandt.