Methoden der Bioinformatik

Die Mikrobiomforschung ist ein komplexes Gebiet, deren Ergebnisse zu interpretieren neben biologischem Verständnis auch eine Grundkenntnis mathematischer und informatischer Methoden voraussetzt. Das Ergebnis, das man am Ende der Analysen erhält, ist abhängig von einer Anzahl an Variablen wie der Probensammlung, und -lagerung, der Aufarbeitung sowie der bioinformatischen und statistischen Auswertung. In diesem Kapitel wird auf die Unterschiede zwischen der Metagenom- sowie der Markergensequenzierung eingegangen, wobei die Schritte von der Sequenzierung über die Erstellung einer Abundanztabelle bis hin zur statistischen Auswertung im Detail beschrieben werden.