Neben infektiösen Lungenkrankheiten kann die Inhalation von Stäuben pflanzlichen oder tierischen Ursprungs zu toxischen und allergischen Atemwegs- oder Lungenkrankheiten führen, insbesondere wenn die Partikel in hohen Konzentrationen eingeatmet werden. Die Anlage 1 zur geltenden Berufskrankheitenverordnung enthält drei Erkrankungen, die sich auf organische Stäube zurückführen lassen: BK 4201, 4202 und 4203. Bei „organischen Stäuben“ handelt es sich um eine komplexe Mischung von Substanzen, die beträchtliche qualitative Unterschiede in der Exposition zwischen einzelnen Tätigkeiten aufweist. Die durch organische Stäube verursachten Krankheiten sind vielfältig. Bei den durch toxische Wirkungen verursachten Atemwegserkrankungen sind das Asthma, das „asthma-like syndrome“ und die COPD sowie das „organic dust toxic syndrome“ (ODTS) zu unterscheiden. Die Byssinose ist eine hinsichtlich ihres Pathomechanismus wenig verstandene, ähnliche Erkrankung, die in Industrienationen selten geworden ist. Bei den exogen allergischen Alveolitiden ist die Farmerlunge, auch Drescherlunge genannt, von besonderer Bedeutung.