Das Kapitel geht insbesondere auf die Beeinträchtigungen von Fließgewässern und deren Auswirkungen auf den Gewässerzustand ein. Dabei werden auch die räumlichen und zeitlichen Skalenebenen erläutert. Es soll ein Verständnis dafür entwickelt werden, auf welchen Skalenebenen welche Maßnahmen am wirksamsten sind, und wo eben nicht. Dafür wird insbesondere auf die Hierarchie der Wirkungsebenen eingegangen. Thematisiert werden Landnutzung, Klima, Wasserqualität, Abflussregime, Geschiebehaushalt, Konnektivität (lateral, longitudinal, vertikal), Gewässerstruktur, Neobiota und Mehrfachbelastungen.