Sequenzbasierte Klassifikation und Identifikation

In diesem Kapitel werden Sie in die Klassifizierung von Prokaryoten von Spezies bis zu den höheren Ebenen von Klassen und Phyla eingeführt. Der Vergleich von 16S-rRNA-Gensequenzen einschließlich der phylogenetischen Analyse liefern die Hauptinformationen für die Klassifizierung. Die Klassifizierung von Spezies erfolgt hauptsächlich aus der Vorhersage von In-silico-DNA-DNA-Hybridisierungen von Genomgenomsequenzen. Im Abschnitt „Aktivitäten“ lernen Sie, ein Isolat aus der 16S-rRNA-Sequenz vom EzBioCloud-Server und durch Gesamtgenomsequenzierung vom Type Strain Genome Server (TYGS) zu identifizieren.