Primer-Design
摘要
In diesem Kapitel wird ein Überblick über das Design von Oligonukleotiden für explorative Untersuchungen und Diagnostik gegeben. Es werden die Kriterien für die Auswahl von Oligonukleotiden, einschließlich der Längen von PCR-Primern, -Produkten und Hybridisierungssonden, die Prinzipien für den Sequenzvergleich sowie die Regeln für die sequenzbasierte Vorhersage der Amplifikation sowie der Schmelztemperaturen erläutert. Anschließend werden Computerprogramme für die verschiedenen Anwendungen von degenerierten Primern; Multiplex-, Nested-Polymerasekettenreaktion(PCR) und Einzelnukleotidpolymorphismen sowie Hybridisierungsmethoden empfohlen. Im Abschnitt „Aktivität“ wird das Design von Oligonukleotiden für die Amplifikation einzelner DNA-Sequenzen mithilfe von PCR und PrimerBLAST für das Design von diagnostischen PCR-Primern demonstriert.